祝由十三科（祝由科）是古代医术的一种流派，即祝说病由，不需用针灸或药来治病，是巫术治疗法。祝由十三科包含大方脉科，主治伤寒痰喘，及一切内症；痘疹科，癰疽疔毒，及淋浊科等。

祝由十三科包含：一曰大方脉科，主治伤寒痰喘，及一切内症。二曰诸风科，主治麻木痈痪，及一切中风。三曰胎产科，主治胎前产後诸病，及一切妇科异症。四曰眼目科，主治青盲白翳，及流行眼疾。五曰小儿科，主治惊风潮热，及一切幼科杂症。六曰口齿科，主治牙痛鱼鲠，及一切喉症。七曰痘疹科，癰疽疔毒，及淋浊科。八曰伤折科，主治压伤骨断，及跌打损伤。九曰耳鼻科，主治耳聋鼻衄及一切耳鼻病。十曰疮肿科，主治癞疥顽癣，及无名肿毒。十一曰金簇科，主治箭伤枪伤，及刀斧铁器伤。十二曰书禁科，主治镇邪驱鬼，及辟毒截疮。十三曰砭针科，主治疯癫，及筋骨疼痛。

祝由治病不用药或少用药，而主用祝由师的意念、符咒产生的场来治疗各种疾病，因此祝由科对祝由医师要求很高、很严，有很多戒律必需遵守。这些要求实际上就是现代气功训练的要求。祝由要求祝由医师清净斋戒百日，目的是使内心平静，心无杂念，意念专一，以达到祝由场纯正，没有邪念浊气干扰，以提高疗效。气功师较佳的功态就是祝由医师治病的先决条件，只须看一看，就可以手到病除，咒出病愈，符进病出。祝由医师必须练气功来提高自己的人体场，才能借助咒语，符图使大自然的能量冲射病变部位，排出病邪、浊气，补充元气，疏通经络，调和脏腑功能。没有相当的气功底子，用祝由“画符念咒”为人治病，无疑是骗人的。学习祝由法必须练气功，可以任选合适的功法。以前有功夫底子的可以坚持练以前的功法，尚未学习者或发放外气不明显者，就应该练习下面的《祝由气功医师速成法》：

坐站均可。两掌心相对，上下隔开三五厘米，指尖相对。二目垂帘，内视掌中，仔细体察双掌感应。双掌轻松地缓慢地作磨盘式对称转动，几秒种或几分钟后，会有气的感觉。能否达到速效，关键在于是否能将全身放松，并将意念集中于掌上仔细体会，有气感时，进一步体会有无排斥力或吸引力，反复练此动作次。当练到一定程度时，好像自己全身任督二脉也在开合，直到每一个毛孔(细胞)都在开合，在呼吸，在交换，在代谢，把大自然的清气、宇宙场收入人体，排出体内的废物。反复训练增强功力，有利于以后运用符图咒语时手到病除，意到病出，气到病愈。以上这些训练动作不但调整自身的生物场，也可调动宇宙场(包括祝由先师们的高能信息物质)进入人体，使气贯注于指端，直达笔毫，深透墨纸之中，或以指代笔书符咒于病灶之上。

人食天地之气以生，内伤于喜怒忧思悲恐惊七情，外伤于风寒暑湿燥火六淫所以生病。然而，黄帝曰：“其无所遇邪气，又无怵惕之所志，卒然而病者，其何致?”可见古人很早就认识到，除了七情、六淫外，还有尚未被认识的治病因素，那就是“鬼神致病说”，所谓鬼神致病，其实是一种心理因素所致的疾病，鬼神是不存在的。古人云：“吾心无鬼，鬼何以侵之，吾心无邪，邪何以扰之，吾心无魔，魔何以袭之。”故鬼神致病皆由心生。祝由治疗疾病的病因大多是心理不健全，故七情、六淫相乘而袭之。有很多种病，是间接由心理因素所致，所以其源在于心。祝由治疗肿瘤是大家公认的，但也局限在心理所致的肿瘤，而并非所有的肿瘤都可以治。有很多器质性病变也是由心理因素所致。所以，这些器官或组织产生的病变祝由亦可治。从气功的角度讲，人体患病无非是心病和身病。心病是祝由治疗的范围，部分身病也属于祝由治疗的范围，但祝由并非包治一切“心病”，要理解到祝由仅仅是医学的补充，不是治病的唯一手段。随着科学技术的不断发展，有很多种病，已经攻克，但有些病仍未找到合适的治疗方法，这也是祝由科流传几千年仍未灭绝的原因。